Protein–RNA interactions for Protein: O60925

PFDN1, Prefoldin subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN1O60925 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PFDN1O60925 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PFDN1O60925 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PFDN1O60925 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PFDN1O60925 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PFDN1O60925 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PFDN1O60925 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PFDN1O60925 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PFDN1O60925 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PFDN1O60925 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PFDN1O60925 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PFDN1O60925 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PFDN1O60925 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PFDN1O60925 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PFDN1O60925 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PFDN1O60925 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PFDN1O60925 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PFDN1O60925 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PFDN1O60925 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PFDN1O60925 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PFDN1O60925 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PFDN1O60925 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PFDN1O60925 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PFDN1O60925 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PFDN1O60925 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PFDN1O60925 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PFDN1O60925 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PFDN1O60925 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PFDN1O60925 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PFDN1O60925 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PFDN1O60925 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PFDN1O60925 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PFDN1O60925 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PFDN1O60925 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PFDN1O60925 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PFDN1O60925 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PFDN1O60925 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PFDN1O60925 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PFDN1O60925 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PFDN1O60925 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PFDN1O60925 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PFDN1O60925 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PFDN1O60925 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PFDN1O60925 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PFDN1O60925 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PFDN1O60925 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PFDN1O60925 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PFDN1O60925 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PFDN1O60925 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PFDN1O60925 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PFDN1O60925 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PFDN1O60925 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PFDN1O60925 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PFDN1O60925 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PFDN1O60925 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PFDN1O60925 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PFDN1O60925 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PFDN1O60925 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PFDN1O60925 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PFDN1O60925 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PFDN1O60925 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PFDN1O60925 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PFDN1O60925 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PFDN1O60925 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PFDN1O60925 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PFDN1O60925 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PFDN1O60925 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PFDN1O60925 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PFDN1O60925 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PFDN1O60925 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PFDN1O60925 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PFDN1O60925 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PFDN1O60925 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PFDN1O60925 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PFDN1O60925 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PFDN1O60925 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PFDN1O60925 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PFDN1O60925 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PFDN1O60925 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PFDN1O60925 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PFDN1O60925 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PFDN1O60925 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PFDN1O60925 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PFDN1O60925 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PFDN1O60925 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PFDN1O60925 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PFDN1O60925 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PFDN1O60925 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PFDN1O60925 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PFDN1O60925 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PFDN1O60925 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PFDN1O60925 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PFDN1O60925 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PFDN1O60925 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PFDN1O60925 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PFDN1O60925 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PFDN1O60925 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PFDN1O60925 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PFDN1O60925 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PFDN1O60925 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms