Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SCO2O43819 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCO2O43819 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCO2O43819 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCO2O43819 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCO2O43819 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCO2O43819 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCO2O43819 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCO2O43819 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCO2O43819 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCO2O43819 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCO2O43819 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SCO2O43819 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCO2O43819 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCO2O43819 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCO2O43819 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCO2O43819 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCO2O43819 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCO2O43819 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCO2O43819 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCO2O43819 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCO2O43819 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCO2O43819 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCO2O43819 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCO2O43819 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCO2O43819 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCO2O43819 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SCO2O43819 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCO2O43819 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCO2O43819 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCO2O43819 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCO2O43819 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCO2O43819 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCO2O43819 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCO2O43819 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCO2O43819 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCO2O43819 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCO2O43819 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCO2O43819 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCO2O43819 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCO2O43819 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCO2O43819 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCO2O43819 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCO2O43819 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SCO2O43819 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCO2O43819 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCO2O43819 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCO2O43819 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCO2O43819 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCO2O43819 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCO2O43819 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCO2O43819 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCO2O43819 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCO2O43819 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCO2O43819 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCO2O43819 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCO2O43819 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCO2O43819 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCO2O43819 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCO2O43819 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCO2O43819 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCO2O43819 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCO2O43819 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCO2O43819 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCO2O43819 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCO2O43819 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCO2O43819 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCO2O43819 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCO2O43819 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCO2O43819 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCO2O43819 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SCO2O43819 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCO2O43819 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCO2O43819 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCO2O43819 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCO2O43819 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCO2O43819 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCO2O43819 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCO2O43819 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCO2O43819 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCO2O43819 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCO2O43819 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCO2O43819 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCO2O43819 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCO2O43819 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCO2O43819 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCO2O43819 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCO2O43819 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCO2O43819 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCO2O43819 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCO2O43819 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCO2O43819 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCO2O43819 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCO2O43819 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCO2O43819 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCO2O43819 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCO2O43819 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCO2O43819 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCO2O43819 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCO2O43819 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms