Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A20O43772 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A20O43772 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A20O43772 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A20O43772 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC25A20O43772 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC25A20O43772 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC25A20O43772 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC25A20O43772 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC25A20O43772 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC25A20O43772 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC25A20O43772 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC25A20O43772 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC25A20O43772 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC25A20O43772 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC25A20O43772 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC25A20O43772 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC25A20O43772 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC25A20O43772 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC25A20O43772 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC25A20O43772 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC25A20O43772 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC25A20O43772 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC25A20O43772 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC25A20O43772 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC25A20O43772 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC25A20O43772 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC25A20O43772 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC25A20O43772 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC25A20O43772 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC25A20O43772 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC25A20O43772 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC25A20O43772 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC25A20O43772 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC25A20O43772 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC25A20O43772 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC25A20O43772 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A20O43772 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A20O43772 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A20O43772 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A20O43772 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A20O43772 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A20O43772 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A20O43772 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC25A20O43772 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC25A20O43772 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC25A20O43772 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC25A20O43772 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC25A20O43772 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A20O43772 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A20O43772 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A20O43772 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A20O43772 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A20O43772 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A20O43772 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A20O43772 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A20O43772 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A20O43772 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC25A20O43772 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC25A20O43772 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC25A20O43772 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A20O43772 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A20O43772 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A20O43772 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A20O43772 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A20O43772 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A20O43772 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A20O43772 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A20O43772 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC25A20O43772 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC25A20O43772 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC25A20O43772 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC25A20O43772 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC25A20O43772 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC25A20O43772 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC25A20O43772 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC25A20O43772 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC25A20O43772 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC25A20O43772 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC25A20O43772 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC25A20O43772 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC25A20O43772 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC25A20O43772 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC25A20O43772 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC25A20O43772 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC25A20O43772 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC25A20O43772 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A20O43772 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A20O43772 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A20O43772 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A20O43772 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC25A20O43772 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC25A20O43772 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC25A20O43772 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC25A20O43772 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC25A20O43772 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC25A20O43772 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC25A20O43772 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC25A20O43772 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC25A20O43772 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms