Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRTM2O43300 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRTM2O43300 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRTM2O43300 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRTM2O43300 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRTM2O43300 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRTM2O43300 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRTM2O43300 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRTM2O43300 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRTM2O43300 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRTM2O43300 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRTM2O43300 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRTM2O43300 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRTM2O43300 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRTM2O43300 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRTM2O43300 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRTM2O43300 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRTM2O43300 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRTM2O43300 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRTM2O43300 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRTM2O43300 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRTM2O43300 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRTM2O43300 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRTM2O43300 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRTM2O43300 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRTM2O43300 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRTM2O43300 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRTM2O43300 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRTM2O43300 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRTM2O43300 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRTM2O43300 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRTM2O43300 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRTM2O43300 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRTM2O43300 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRTM2O43300 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRTM2O43300 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRTM2O43300 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRTM2O43300 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRTM2O43300 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRTM2O43300 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRTM2O43300 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRTM2O43300 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRTM2O43300 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRTM2O43300 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRTM2O43300 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRTM2O43300 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRTM2O43300 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRTM2O43300 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRTM2O43300 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRTM2O43300 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRTM2O43300 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRTM2O43300 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRTM2O43300 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRTM2O43300 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRTM2O43300 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRTM2O43300 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRTM2O43300 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRTM2O43300 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRTM2O43300 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRTM2O43300 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRTM2O43300 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRTM2O43300 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRTM2O43300 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRTM2O43300 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRTM2O43300 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRTM2O43300 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRTM2O43300 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRTM2O43300 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRTM2O43300 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRTM2O43300 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRTM2O43300 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
LRRTM2O43300 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRTM2O43300 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRTM2O43300 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRTM2O43300 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRTM2O43300 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRTM2O43300 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRTM2O43300 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRTM2O43300 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRTM2O43300 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRTM2O43300 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRTM2O43300 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRTM2O43300 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRTM2O43300 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRTM2O43300 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRTM2O43300 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRTM2O43300 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRTM2O43300 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRTM2O43300 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRTM2O43300 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRTM2O43300 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRTM2O43300 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRTM2O43300 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRTM2O43300 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRTM2O43300 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRTM2O43300 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRTM2O43300 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRTM2O43300 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRTM2O43300 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRTM2O43300 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
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