Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HOXC11O43248 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HOXC11O43248 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
HOXC11O43248 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HOXC11O43248 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HOXC11O43248 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HOXC11O43248 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HOXC11O43248 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HOXC11O43248 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HOXC11O43248 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HOXC11O43248 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HOXC11O43248 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXC11O43248 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXC11O43248 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXC11O43248 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXC11O43248 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXC11O43248 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HOXC11O43248 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXC11O43248 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXC11O43248 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HOXC11O43248 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HOXC11O43248 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HOXC11O43248 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXC11O43248 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXC11O43248 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXC11O43248 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HOXC11O43248 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HOXC11O43248 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXC11O43248 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXC11O43248 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXC11O43248 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXC11O43248 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXC11O43248 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXC11O43248 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXC11O43248 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXC11O43248 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXC11O43248 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HOXC11O43248 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXC11O43248 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
HOXC11O43248 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HOXC11O43248 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXC11O43248 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HOXC11O43248 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXC11O43248 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXC11O43248 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HOXC11O43248 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HOXC11O43248 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HOXC11O43248 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXC11O43248 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXC11O43248 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXC11O43248 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HOXC11O43248 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HOXC11O43248 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HOXC11O43248 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HOXC11O43248 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HOXC11O43248 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXC11O43248 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXC11O43248 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HOXC11O43248 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXC11O43248 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
HOXC11O43248 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXC11O43248 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXC11O43248 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXC11O43248 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXC11O43248 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXC11O43248 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXC11O43248 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXC11O43248 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXC11O43248 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXC11O43248 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXC11O43248 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXC11O43248 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HOXC11O43248 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HOXC11O43248 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXC11O43248 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HOXC11O43248 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXC11O43248 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXC11O43248 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXC11O43248 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXC11O43248 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HOXC11O43248 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXC11O43248 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXC11O43248 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXC11O43248 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HOXC11O43248 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HOXC11O43248 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HOXC11O43248 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXC11O43248 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXC11O43248 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXC11O43248 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXC11O43248 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXC11O43248 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HOXC11O43248 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXC11O43248 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXC11O43248 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXC11O43248 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HOXC11O43248 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HOXC11O43248 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXC11O43248 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXC11O43248 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms