Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
FANCAO15360 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
FANCAO15360 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC45.66■■■■■ 4.9
FANCAO15360 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.63■■■■■ 4.9
FANCAO15360 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC45.62■■■■■ 4.89
FANCAO15360 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC45.55■■■■■ 4.88
FANCAO15360 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC45.51■■■■■ 4.88
FANCAO15360 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC45.5■■■■■ 4.87
FANCAO15360 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
FANCAO15360 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.48■■■■■ 4.87
FANCAO15360 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.47■■■■■ 4.87
FANCAO15360 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC45.46■■■■■ 4.87
FANCAO15360 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC45.42■■■■■ 4.86
FANCAO15360 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.38■■■■■ 4.86
FANCAO15360 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
FANCAO15360 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.36■■■■■ 4.85
FANCAO15360 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC45.22■■■■■ 4.83
FANCAO15360 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
FANCAO15360 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
FANCAO15360 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC45.2■■■■■ 4.83
FANCAO15360 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
FANCAO15360 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC45.17■■■■■ 4.82
FANCAO15360 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC45.09■■■■■ 4.81
FANCAO15360 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC45.09■■■■■ 4.81
FANCAO15360 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
FANCAO15360 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC45.03■■■■■ 4.8
FANCAO15360 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
FANCAO15360 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
FANCAO15360 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC44.98■■■■■ 4.79
FANCAO15360 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC44.96■■■■■ 4.79
FANCAO15360 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC44.94■■■■■ 4.78
FANCAO15360 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.89■■■■■ 4.78
FANCAO15360 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
FANCAO15360 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
FANCAO15360 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
FANCAO15360 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC44.83■■■■■ 4.77
FANCAO15360 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC44.83■■■■■ 4.77
FANCAO15360 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
FANCAO15360 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC44.82■■■■■ 4.76
FANCAO15360 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
FANCAO15360 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
FANCAO15360 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC44.78■■■■■ 4.76
FANCAO15360 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC44.73■■■■■ 4.75
FANCAO15360 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
FANCAO15360 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC44.69■■■■■ 4.74
FANCAO15360 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
FANCAO15360 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC44.63■■■■■ 4.73
FANCAO15360 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC44.63■■■■■ 4.73
FANCAO15360 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.62■■■■■ 4.73
FANCAO15360 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
FANCAO15360 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
FANCAO15360 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC44.58■■■■■ 4.73
FANCAO15360 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC44.56■■■■■ 4.72
FANCAO15360 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.53■■■■■ 4.72
FANCAO15360 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC44.53■■■■■ 4.72
FANCAO15360 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
FANCAO15360 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
FANCAO15360 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.71
FANCAO15360 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC44.39■■■■■ 4.7
FANCAO15360 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
FANCAO15360 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
FANCAO15360 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC44.27■■■■■ 4.68
FANCAO15360 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
FANCAO15360 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.67
FANCAO15360 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.18■■■■■ 4.66
FANCAO15360 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC44.16■■■■■ 4.66
FANCAO15360 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC44.15■■■■■ 4.66
FANCAO15360 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC44.15■■■■■ 4.66
FANCAO15360 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
FANCAO15360 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC44.1■■■■■ 4.65
FANCAO15360 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.09■■■■■ 4.65
FANCAO15360 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
FANCAO15360 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
FANCAO15360 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
FANCAO15360 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
FANCAO15360 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.01■■■■■ 4.64
FANCAO15360 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
FANCAO15360 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC44■■■■■ 4.63
FANCAO15360 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC44■■■■■ 4.63
FANCAO15360 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
FANCAO15360 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
FANCAO15360 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC43.96■■■■■ 4.63
FANCAO15360 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
FANCAO15360 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC43.94■■■■■ 4.63
FANCAO15360 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.63
FANCAO15360 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
FANCAO15360 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
FANCAO15360 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
FANCAO15360 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
FANCAO15360 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC43.87■■■■■ 4.61
FANCAO15360 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
FANCAO15360 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
FANCAO15360 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
FANCAO15360 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
FANCAO15360 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
FANCAO15360 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC43.8■■■■■ 4.6
FANCAO15360 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC43.76■■■■■ 4.6
FANCAO15360 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
FANCAO15360 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC43.76■■■■■ 4.6
FANCAO15360 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms