Protein–RNA interactions for Protein: O15194

CTDSPL, CTD small phosphatase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPLO15194 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTDSPLO15194 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTDSPLO15194 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTDSPLO15194 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTDSPLO15194 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTDSPLO15194 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTDSPLO15194 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDSPLO15194 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTDSPLO15194 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTDSPLO15194 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTDSPLO15194 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTDSPLO15194 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTDSPLO15194 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTDSPLO15194 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTDSPLO15194 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTDSPLO15194 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTDSPLO15194 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CTDSPLO15194 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTDSPLO15194 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTDSPLO15194 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTDSPLO15194 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTDSPLO15194 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTDSPLO15194 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTDSPLO15194 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDSPLO15194 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTDSPLO15194 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTDSPLO15194 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTDSPLO15194 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTDSPLO15194 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTDSPLO15194 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTDSPLO15194 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTDSPLO15194 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTDSPLO15194 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTDSPLO15194 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTDSPLO15194 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTDSPLO15194 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTDSPLO15194 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTDSPLO15194 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTDSPLO15194 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTDSPLO15194 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTDSPLO15194 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTDSPLO15194 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDSPLO15194 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTDSPLO15194 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDSPLO15194 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDSPLO15194 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDSPLO15194 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDSPLO15194 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDSPLO15194 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDSPLO15194 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDSPLO15194 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDSPLO15194 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTDSPLO15194 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTDSPLO15194 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTDSPLO15194 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTDSPLO15194 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTDSPLO15194 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTDSPLO15194 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTDSPLO15194 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTDSPLO15194 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTDSPLO15194 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTDSPLO15194 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTDSPLO15194 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTDSPLO15194 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTDSPLO15194 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTDSPLO15194 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTDSPLO15194 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTDSPLO15194 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTDSPLO15194 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTDSPLO15194 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTDSPLO15194 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTDSPLO15194 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDSPLO15194 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDSPLO15194 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDSPLO15194 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTDSPLO15194 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTDSPLO15194 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTDSPLO15194 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDSPLO15194 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDSPLO15194 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDSPLO15194 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDSPLO15194 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDSPLO15194 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDSPLO15194 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTDSPLO15194 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTDSPLO15194 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTDSPLO15194 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTDSPLO15194 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTDSPLO15194 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTDSPLO15194 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTDSPLO15194 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTDSPLO15194 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDSPLO15194 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDSPLO15194 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDSPLO15194 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDSPLO15194 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDSPLO15194 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDSPLO15194 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDSPLO15194 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDSPLO15194 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms