Protein–RNA interactions for Protein: H3BQZ7

HNRNPUL2-BSCL2, HCG2044799, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.54■■■■■ 5.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC46.52■■■■■ 5.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.45■■■■■ 5.03
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC46.45■■■■■ 5.03
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC46.45■■■■■ 5.03
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC46.41■■■■■ 5.02
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.38■■■■■ 5.02
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC46.35■■■■■ 5.01
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC46.33■■■■■ 5.01
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.3■■■■■ 5
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.23■■■■■ 4.99
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC46.23■■■■■ 4.99
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC46.22■■■■■ 4.99
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC46.22■■■■■ 4.99
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC46.21■■■■■ 4.99
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.18■■■■■ 4.98
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.16■■■■■ 4.98
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC46.1■■■■■ 4.97
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC46.09■■■■■ 4.97
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC46.03■■■■■ 4.96
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.95
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC45.91■■■■■ 4.94
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC45.9■■■■■ 4.94
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC45.78■■■■■ 4.92
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC45.77■■■■■ 4.92
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC45.75■■■■■ 4.91
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC45.69■■■■■ 4.9
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC45.69■■■■■ 4.9
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC45.62■■■■■ 4.89
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC45.61■■■■■ 4.89
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC45.58■■■■■ 4.89
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.57■■■■■ 4.89
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC45.48■■■■■ 4.87
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC45.46■■■■■ 4.87
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC45.4■■■■■ 4.86
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC45.35■■■■■ 4.85
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.35■■■■■ 4.85
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC45.34■■■■■ 4.85
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC45.33■■■■■ 4.85
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC45.33■■■■■ 4.85
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC45.31■■■■■ 4.84
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC45.21■■■■■ 4.83
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC45.21■■■■■ 4.83
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.2■■■■■ 4.83
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC45.18■■■■■ 4.82
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC45.12■■■■■ 4.81
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC45.07■■■■■ 4.81
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC45.06■■■■■ 4.8
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.03■■■■■ 4.8
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.9■■■■■ 4.78
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC44.88■■■■■ 4.78
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC44.88■■■■■ 4.78
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC44.85■■■■■ 4.77
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC44.84■■■■■ 4.77
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC44.82■■■■■ 4.77
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC44.75■■■■■ 4.75
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC44.7■■■■■ 4.75
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC44.65■■■■■ 4.74
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms