Protein–RNA interactions for Protein: H3BM21

Integrin beta (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BM21 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
H3BM21 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
H3BM21 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
H3BM21 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
H3BM21 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
H3BM21 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
H3BM21 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
H3BM21 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
H3BM21 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
H3BM21 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
H3BM21 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
H3BM21 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
H3BM21 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
H3BM21 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
H3BM21 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
H3BM21 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
H3BM21 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
H3BM21 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
H3BM21 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
H3BM21 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
H3BM21 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
H3BM21 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
H3BM21 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
H3BM21 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
H3BM21 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
H3BM21 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
H3BM21 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
H3BM21 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
H3BM21 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
H3BM21 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
H3BM21 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
H3BM21 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
H3BM21 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
H3BM21 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
H3BM21 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
H3BM21 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
H3BM21 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
H3BM21 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
H3BM21 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
H3BM21 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
H3BM21 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
H3BM21 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
H3BM21 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
H3BM21 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
H3BM21 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
H3BM21 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
H3BM21 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
H3BM21 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
H3BM21 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
H3BM21 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
H3BM21 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
H3BM21 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
H3BM21 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
H3BM21 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
H3BM21 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
H3BM21 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
H3BM21 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
H3BM21 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
H3BM21 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
H3BM21 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
H3BM21 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
H3BM21 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
H3BM21 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
H3BM21 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
H3BM21 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
H3BM21 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
H3BM21 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
H3BM21 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
H3BM21 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
H3BM21 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
H3BM21 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
H3BM21 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
H3BM21 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
H3BM21 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
H3BM21 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
H3BM21 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
H3BM21 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
H3BM21 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
H3BM21 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
H3BM21 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
H3BM21 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
H3BM21 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
H3BM21 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
H3BM21 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
H3BM21 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
H3BM21 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
H3BM21 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
H3BM21 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
H3BM21 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
H3BM21 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
H3BM21 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
H3BM21 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
H3BM21 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
H3BM21 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
H3BM21 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
H3BM21 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
H3BM21 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
H3BM21 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
H3BM21 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
H3BM21 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms