Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC9

SH2D7, SH2 domain-containing protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D7A6NKC9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH2D7A6NKC9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH2D7A6NKC9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH2D7A6NKC9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH2D7A6NKC9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH2D7A6NKC9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH2D7A6NKC9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2D7A6NKC9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D7A6NKC9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D7A6NKC9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2D7A6NKC9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2D7A6NKC9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D7A6NKC9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2D7A6NKC9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2D7A6NKC9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2D7A6NKC9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2D7A6NKC9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2D7A6NKC9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2D7A6NKC9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2D7A6NKC9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2D7A6NKC9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2D7A6NKC9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2D7A6NKC9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH2D7A6NKC9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2D7A6NKC9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2D7A6NKC9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH2D7A6NKC9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2D7A6NKC9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2D7A6NKC9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2D7A6NKC9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2D7A6NKC9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2D7A6NKC9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH2D7A6NKC9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D7A6NKC9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D7A6NKC9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D7A6NKC9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D7A6NKC9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2D7A6NKC9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D7A6NKC9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D7A6NKC9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D7A6NKC9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D7A6NKC9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2D7A6NKC9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2D7A6NKC9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2D7A6NKC9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2D7A6NKC9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2D7A6NKC9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D7A6NKC9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2D7A6NKC9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2D7A6NKC9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2D7A6NKC9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH2D7A6NKC9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH2D7A6NKC9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2D7A6NKC9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH2D7A6NKC9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH2D7A6NKC9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH2D7A6NKC9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH2D7A6NKC9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH2D7A6NKC9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH2D7A6NKC9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH2D7A6NKC9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH2D7A6NKC9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2D7A6NKC9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH2D7A6NKC9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH2D7A6NKC9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2D7A6NKC9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2D7A6NKC9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2D7A6NKC9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2D7A6NKC9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2D7A6NKC9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2D7A6NKC9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D7A6NKC9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D7A6NKC9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D7A6NKC9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D7A6NKC9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D7A6NKC9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D7A6NKC9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D7A6NKC9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D7A6NKC9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D7A6NKC9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D7A6NKC9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2D7A6NKC9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2D7A6NKC9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2D7A6NKC9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2D7A6NKC9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2D7A6NKC9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH2D7A6NKC9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2D7A6NKC9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2D7A6NKC9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH2D7A6NKC9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2D7A6NKC9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2D7A6NKC9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2D7A6NKC9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2D7A6NKC9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2D7A6NKC9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2D7A6NKC9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2D7A6NKC9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2D7A6NKC9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH2D7A6NKC9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH2D7A6NKC9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms