Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6N4

TRBV25-1, T-cell receptor beta variable 25-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV25-1A0A075B6N4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRBV25-1A0A075B6N4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRBV25-1A0A075B6N4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRBV25-1A0A075B6N4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRBV25-1A0A075B6N4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRBV25-1A0A075B6N4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRBV25-1A0A075B6N4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRBV25-1A0A075B6N4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRBV25-1A0A075B6N4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRBV25-1A0A075B6N4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRBV25-1A0A075B6N4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRBV25-1A0A075B6N4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRBV25-1A0A075B6N4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRBV25-1A0A075B6N4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRBV25-1A0A075B6N4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRBV25-1A0A075B6N4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRBV25-1A0A075B6N4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRBV25-1A0A075B6N4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRBV25-1A0A075B6N4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRBV25-1A0A075B6N4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRBV25-1A0A075B6N4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRBV25-1A0A075B6N4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRBV25-1A0A075B6N4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRBV25-1A0A075B6N4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRBV25-1A0A075B6N4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRBV25-1A0A075B6N4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRBV25-1A0A075B6N4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRBV25-1A0A075B6N4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRBV25-1A0A075B6N4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRBV25-1A0A075B6N4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV25-1A0A075B6N4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV25-1A0A075B6N4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRBV25-1A0A075B6N4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRBV25-1A0A075B6N4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRBV25-1A0A075B6N4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRBV25-1A0A075B6N4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRBV25-1A0A075B6N4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRBV25-1A0A075B6N4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRBV25-1A0A075B6N4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRBV25-1A0A075B6N4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRBV25-1A0A075B6N4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRBV25-1A0A075B6N4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRBV25-1A0A075B6N4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRBV25-1A0A075B6N4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRBV25-1A0A075B6N4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRBV25-1A0A075B6N4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRBV25-1A0A075B6N4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRBV25-1A0A075B6N4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRBV25-1A0A075B6N4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRBV25-1A0A075B6N4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRBV25-1A0A075B6N4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRBV25-1A0A075B6N4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRBV25-1A0A075B6N4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV25-1A0A075B6N4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRBV25-1A0A075B6N4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRBV25-1A0A075B6N4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRBV25-1A0A075B6N4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRBV25-1A0A075B6N4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRBV25-1A0A075B6N4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRBV25-1A0A075B6N4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV25-1A0A075B6N4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV25-1A0A075B6N4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV25-1A0A075B6N4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV25-1A0A075B6N4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV25-1A0A075B6N4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV25-1A0A075B6N4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV25-1A0A075B6N4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRBV25-1A0A075B6N4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV25-1A0A075B6N4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV25-1A0A075B6N4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV25-1A0A075B6N4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV25-1A0A075B6N4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV25-1A0A075B6N4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRBV25-1A0A075B6N4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRBV25-1A0A075B6N4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV25-1A0A075B6N4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRBV25-1A0A075B6N4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV25-1A0A075B6N4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV25-1A0A075B6N4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRBV25-1A0A075B6N4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRBV25-1A0A075B6N4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRBV25-1A0A075B6N4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRBV25-1A0A075B6N4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRBV25-1A0A075B6N4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRBV25-1A0A075B6N4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRBV25-1A0A075B6N4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRBV25-1A0A075B6N4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRBV25-1A0A075B6N4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRBV25-1A0A075B6N4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRBV25-1A0A075B6N4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRBV25-1A0A075B6N4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRBV25-1A0A075B6N4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRBV25-1A0A075B6N4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRBV25-1A0A075B6N4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRBV25-1A0A075B6N4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRBV25-1A0A075B6N4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRBV25-1A0A075B6N4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRBV25-1A0A075B6N4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRBV25-1A0A075B6N4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRBV25-1A0A075B6N4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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