Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.334e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 RIPOR1-217ENST00000566907 634 ntTSL 412.45□□□□□ -0.424e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 RIPOR1-205ENST00000540839 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.454e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 RIPOR1-202ENST00000379312 4116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.464e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 RIPOR1-201ENST00000042381 4051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.544e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 RIPOR1-203ENST00000422602 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.614e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 RBMS1-206ENST00000428519 583 ntTSL 48.11□□□□□ -1.114e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 UBE2D3-203ENST00000343106 2389 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.751e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.691e-323■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 OGT-207ENST00000466181 421 ntTSL 53.2□□□□□ -1.97e-11■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.777e-8■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.517e-8■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.077e-8■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 SF3B1-212ENST00000496458 475 ntTSL 26.36□□□□□ -1.392e-9■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.511e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 SMPD4-207ENST00000435455 842 ntTSL 515.5■□□□□ 0.071e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 SMPD4-213ENST00000454468 3586 ntTSL 1 (best)12.29□□□□□ -0.441e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 SMPD4-209ENST00000439886 3371 ntTSL 212.22□□□□□ -0.451e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 SMPD4-204ENST00000430682 820 ntTSL 311.82□□□□□ -0.521e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 SMPD4-212ENST00000451542 796 ntTSL 511.54□□□□□ -0.561e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 SMPD4-217ENST00000473720 555 ntTSL 411.36□□□□□ -0.591e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 SMPD4-205ENST00000431183 3614 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.621e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 SMPD4-206ENST00000433118 3335 ntTSL 511.08□□□□□ -0.641e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 SMPD4-201ENST00000351288 3661 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.71e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 SMPD4-203ENST00000412570 3601 ntTSL 29.58□□□□□ -0.881e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 SMPD4-208ENST00000439029 566 ntTSL 49.14□□□□□ -0.951e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 BRD4-203ENST00000371835 4624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.457e-8■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 BRD4-201ENST00000263377 7169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.527e-8■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 BRD4-209ENST00000601071 430 ntTSL 55.86□□□□□ -1.477e-8■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.935e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 ENGASE-206ENST00000579809 1428 ntTSL 1 (best)18.35■□□□□ 0.535e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 LYSMD1-201ENST00000368908 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.615e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 LYSMD1-202ENST00000440902 1003 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.195e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 DYNC1H1-204ENST00000555062 1351 ntTSL 218.39■□□□□ 0.533e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.557e-7■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 ACAA1-212ENST00000460424 538 ntTSL 421.98■■□□□ 1.111e-7■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 RAB10-204ENST00000495146 1292 ntTSL 521.88■■□□□ 1.095e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 ACAA1-218ENST00000489559 579 ntTSL 421.25■□□□□ 0.991e-7■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 DDIT4-203ENST00000473155 753 ntTSL 1 (best)19.78■□□□□ 0.765e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 ACAA1-204ENST00000418880 737 ntTSL 318.94■□□□□ 0.621e-7■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.615e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 NPEPL1-205ENST00000527081 2061 ntTSL 218.84■□□□□ 0.615e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 ALOX12P2-209ENST00000574271 984 ntTSL 318.47■□□□□ 0.555e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.465e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 BAG6-250ENST00000451898 993 ntTSL 317.81■□□□□ 0.445e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 EEF1B2-207ENST00000445505 515 ntTSL 517.67■□□□□ 0.425e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 ACAA1-217ENST00000484284 580 ntTSL 217.17■□□□□ 0.341e-7■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.15■□□□□ 0.345e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 SPPL2B-210ENST00000614784 1411 ntTSL 1 (best)17.08■□□□□ 0.325e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 SPCS2-208ENST00000532972 839 ntTSL 217.04■□□□□ 0.328e-8■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 MVD-211ENST00000565720 436 ntTSL 317■□□□□ 0.311e-7■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.88■□□□□ 0.295e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.295e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 BAG6-248ENST00000441054 654 ntTSL 316.79■□□□□ 0.285e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.288e-8■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.241e-7■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.238e-8■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 TP73-AS1-209ENST00000636630 2529 ntTSL 516.34■□□□□ 0.215e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 SPCS2-204ENST00000527225 321 ntTSL 516.28■□□□□ 0.28e-8■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 ALOX12P2-202ENST00000570890 2209 ntTSL 1 (best)16.21■□□□□ 0.195e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.178e-8■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 BAG6-240ENST00000424480 1056 ntTSL 215.98■□□□□ 0.155e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 TP73-AS1-204ENST00000452079 6358 ntTSL 1 (best)15.63■□□□□ 0.095e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.055e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 ALOX12P2-204ENST00000571201 480 ntTSL 515.27■□□□□ 0.045e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.035e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 PHF1-203ENST00000427004 609 ntTSL 414.63□□□□□ -0.071e-7■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 NPEPL1-202ENST00000525068 768 ntTSL 214.45□□□□□ -0.15e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 APEX1-204ENST00000553368 304 ntTSL 314.3□□□□□ -0.125e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 EEF1B2-210ENST00000479587 701 ntTSL 214.27□□□□□ -0.135e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 ITPA-206ENST00000461029 378 ntTSL 514.02□□□□□ -0.173e-13■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 SPCS2-205ENST00000527290 265 ntTSL 214.01□□□□□ -0.178e-8■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.195e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 APEX1-205ENST00000553555 1603 ntTSL 1 (best)13.68□□□□□ -0.225e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 ALOX12P2-212ENST00000576636 574 ntTSL 413.68□□□□□ -0.225e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 APEX1-216ENST00000557159 1803 ntTSL 213.39□□□□□ -0.275e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.275e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.278e-8■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.285e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.325e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 RAB10-201ENST00000264710 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.325e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 PRRC2C-208ENST00000476522 1931 ntTSL 512.86□□□□□ -0.358e-8■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 APEX1-208ENST00000554813 654 ntTSL 312.62□□□□□ -0.395e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 APEX1-211ENST00000555839 952 ntTSL 212.62□□□□□ -0.395e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.41e-7■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 PHF1-206ENST00000459809 461 ntTSL 412.49□□□□□ -0.411e-7■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.413e-9■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 APEX1-215ENST00000557150 740 ntTSL 312.38□□□□□ -0.435e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 TP73-AS1-201ENST00000418088 3329 ntTSL 1 (best)12.22□□□□□ -0.455e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 APEX1-213ENST00000556296 571 ntTSL 412.18□□□□□ -0.465e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 APEX1-207ENST00000554325 568 ntTSL 512.16□□□□□ -0.465e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 APEX1-217ENST00000557181 566 ntTSL 312.16□□□□□ -0.465e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.471e-7■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 PKM-208ENST00000563275 699 ntTSL 1 (best)11.92□□□□□ -0.58e-8■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 APEX1-209ENST00000555306 898 ntTSL 511.8□□□□□ -0.525e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 APEX1-212ENST00000556054 773 ntTSL 311.8□□□□□ -0.525e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 APEX1-219ENST00000557365 831 ntTSL 311.8□□□□□ -0.525e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 BAG6-255ENST00000456622 859 ntTSL 511.72□□□□□ -0.535e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 HYOU1-208ENST00000531682 319 ntTSL 211.66□□□□□ -0.545e-6■□□□□ 8.5
PRPF4O43172 HNRNPC-204ENST00000449098 1599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.551e-7■□□□□ 8.5
Retrieved 100 of 20,551 protein–RNA pairs in 413.2 ms