RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495146.5

RAB10-204, Transcript of RAB10, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 5

Gene RAB10, Length 1,292 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB10-204ENST00000495146 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.38■■■■■ 6.94
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RAB10-204ENST00000495146 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.46■■■■■ 5.99
RAB10-204ENST00000495146 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.95■■■■■ 5.59
RAB10-204ENST00000495146 NACADO15069 1562 aa49.58■■■■■ 5.53
RAB10-204ENST00000495146 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.44■■■■■ 5.51
RAB10-204ENST00000495146 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.12■■■■■ 5.45
RAB10-204ENST00000495146 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.9■■■■■ 5.42
RAB10-204ENST00000495146 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.89■■■■■ 5.42
RAB10-204ENST00000495146 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.86■■■■■ 5.41
RAB10-204ENST00000495146 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.6■■■■■ 5.37
RAB10-204ENST00000495146 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.41■■■■■ 5.34
RAB10-204ENST00000495146 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.23■■■■■ 5.31
RAB10-204ENST00000495146 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.89■■■■■ 5.26
RAB10-204ENST00000495146 SCRIBQ14160 1630 aa47.78■■■■■ 5.24
RAB10-204ENST00000495146 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.48■■■■■ 5.19
RAB10-204ENST00000495146 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.37■■■■■ 5.17
RAB10-204ENST00000495146 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.34■■■■■ 5.17
RAB10-204ENST00000495146 NCAPD3P42695 1498 aa45.8■■■■■ 4.92
RAB10-204ENST00000495146 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.65■■■■■ 4.9
RAB10-204ENST00000495146 SMARCA4P51532 1647 aa45.59■■■■■ 4.89
RAB10-204ENST00000495146 SMARCA2P51531 1590 aa45.49■■■■■ 4.87
RAB10-204ENST00000495146 HMGXB3Q12766 1538 aa45.47■■■■■ 4.87
RAB10-204ENST00000495146 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.42■■■■■ 4.86
RAB10-204ENST00000495146 CUX2O14529 1486 aa45.35■■■■■ 4.85
RAB10-204ENST00000495146 ERCC6Q03468 1493 aa45.33■■■■■ 4.85
RAB10-204ENST00000495146 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.31■■■■■ 4.84
RAB10-204ENST00000495146 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.17■■■■■ 4.82
RAB10-204ENST00000495146 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.17■■■■■ 4.82
RAB10-204ENST00000495146 NESP48681 1621 aa45.15■■■■■ 4.82
RAB10-204ENST00000495146 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.01■■■■■ 4.8
RAB10-204ENST00000495146 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.77■■■■■ 4.76
RAB10-204ENST00000495146 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.76■■■■■ 4.76
RAB10-204ENST00000495146 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.56■■■■■ 4.72
RAB10-204ENST00000495146 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.47■■■■■ 4.71
RAB10-204ENST00000495146 WIZO95785 1651 aa44.44■■■■■ 4.7
RAB10-204ENST00000495146 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.37■■■■■ 4.69
RAB10-204ENST00000495146 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.15■■■■■ 4.66
RAB10-204ENST00000495146 WDR62O43379 1518 aa44.09■■■■■ 4.65
RAB10-204ENST00000495146 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.01■■■■■ 4.64
RAB10-204ENST00000495146 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.94■■■■■ 4.62
RAB10-204ENST00000495146 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.89■■■■■ 4.62
RAB10-204ENST00000495146 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
RAB10-204ENST00000495146 CFTRP13569 1480 aa43.88■■■■■ 4.61
RAB10-204ENST00000495146 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.58■■■■■ 4.57
RAB10-204ENST00000495146 PRDM2Q13029 1718 aa43.43■■■■■ 4.54
RAB10-204ENST00000495146 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.37■■■■■ 4.53
RAB10-204ENST00000495146 TRIM41Q8WV44 630 aa43.31■■■■■ 4.52
RAB10-204ENST00000495146 OSCARQ8IYS5 282 aa43.14■■■■■ 4.5
RAB10-204ENST00000495146 TOPBP1Q92547 1522 aa43.07■■■■■ 4.48
RAB10-204ENST00000495146 IFT140Q96RY7 1462 aa43.06■■■■■ 4.48
RAB10-204ENST00000495146 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.06■■■■■ 4.48
RAB10-204ENST00000495146 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.89■■■■■ 4.46
RAB10-204ENST00000495146 ABCC8Q09428 1581 aa42.87■■■■■ 4.45
RAB10-204ENST00000495146 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.82■■■■■ 4.44
RAB10-204ENST00000495146 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.73■■■■■ 4.43
RAB10-204ENST00000495146 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.73■■■■■ 4.43
RAB10-204ENST00000495146 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.73■■■■■ 4.43
RAB10-204ENST00000495146 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.72■■■■■ 4.43
RAB10-204ENST00000495146 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.62■■■■■ 4.41
RAB10-204ENST00000495146 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.61■■■■■ 4.41
RAB10-204ENST00000495146 ARHGEF11O15085 1522 aa42.59■■■■■ 4.41
RAB10-204ENST00000495146 CHD1O14646 1710 aa42.51■■■■■ 4.4
RAB10-204ENST00000495146 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.46■■■■■ 4.39
RAB10-204ENST00000495146 SOGA1O94964 1423 aa42.35■■■■■ 4.37
RAB10-204ENST00000495146 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.32■■■■■ 4.37
RAB10-204ENST00000495146 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.31■■■■■ 4.36
RAB10-204ENST00000495146 CUX1P39880 1505 aa42.3■■■■■ 4.36
RAB10-204ENST00000495146 WDR97A6NE52 1622 aa42.24■■■■■ 4.35
RAB10-204ENST00000495146 FBLN2P98095 1184 aa42.23■■■■■ 4.35
RAB10-204ENST00000495146 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.19■■■■■ 4.34
RAB10-204ENST00000495146 ARAP1Q96P48 1450 aa42.19■■■■■ 4.34
RAB10-204ENST00000495146 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.15■■■■■ 4.34
RAB10-204ENST00000495146 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.05■■■■■ 4.32
RAB10-204ENST00000495146 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.05■■■■■ 4.32
RAB10-204ENST00000495146 GRIN2BQ13224 1484 aa42.03■■■■■ 4.32
RAB10-204ENST00000495146 SYNJ1O43426 1573 aa41.93■■■■■ 4.3
RAB10-204ENST00000495146 SYNJ2O15056 1496 aa41.92■■■■■ 4.3
RAB10-204ENST00000495146 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.91■■■■■ 4.3
RAB10-204ENST00000495146 PBRM1Q86U86 1689 aa41.89■■■■■ 4.3
RAB10-204ENST00000495146 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.85■■■■■ 4.29
RAB10-204ENST00000495146 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.85■■■■■ 4.29
RAB10-204ENST00000495146 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.83■■■■■ 4.29
RAB10-204ENST00000495146 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.83■■■■■ 4.29
RAB10-204ENST00000495146 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
RAB10-204ENST00000495146 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.59■■■■■ 4.252e-6■■□□□ 11.9
RAB10-204ENST00000495146 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.58■■■■■ 4.25
RAB10-204ENST00000495146 TOP2BQ02880 1626 aa41.56■■■■■ 4.24
RAB10-204ENST00000495146 ADAMTS12P58397 1594 aa41.52■■■■■ 4.24
RAB10-204ENST00000495146 GRIN2AQ12879 1464 aa41.52■■■■■ 4.24
RAB10-204ENST00000495146 CEP170Q5SW79 1584 aa41.42■■■■■ 4.22
RAB10-204ENST00000495146 NUP160Q12769 1436 aa41.41■■■■■ 4.22
RAB10-204ENST00000495146 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.4■■■■■ 4.22
RAB10-204ENST00000495146 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.33■■■■■ 4.21
RAB10-204ENST00000495146 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.3■■■■■ 4.2
RAB10-204ENST00000495146 SHROOM2Q13796 1616 aa41.26■■■■■ 4.19
RAB10-204ENST00000495146 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.96■■■■■ 4.15
RAB10-204ENST00000495146 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.94■■■■■ 4.14
RAB10-204ENST00000495146 JPH4Q96JJ6 628 aa40.86■■■■■ 4.13
RAB10-204ENST00000495146 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.74■■■■■ 4.11
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