Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC38.82■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC38.82■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC38.82■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
TNIKQ9UKE5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC38.79■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC38.77■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
TNIKQ9UKE5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.79
TNIKQ9UKE5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.79
TNIKQ9UKE5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
TNIKQ9UKE5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
TNIKQ9UKE5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
TNIKQ9UKE5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
TNIKQ9UKE5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
TNIKQ9UKE5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
TNIKQ9UKE5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
TNIKQ9UKE5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
TNIKQ9UKE5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
TNIKQ9UKE5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
TNIKQ9UKE5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
TNIKQ9UKE5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
TNIKQ9UKE5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
TNIKQ9UKE5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC38.71■■■■□ 3.79
TNIKQ9UKE5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
TNIKQ9UKE5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
TNIKQ9UKE5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
TNIKQ9UKE5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
TNIKQ9UKE5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
TNIKQ9UKE5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
TNIKQ9UKE5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
TNIKQ9UKE5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC38.7■■■■□ 3.79
TNIKQ9UKE5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.78
TNIKQ9UKE5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.78
TNIKQ9UKE5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
TNIKQ9UKE5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
TNIKQ9UKE5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
TNIKQ9UKE5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
TNIKQ9UKE5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
TNIKQ9UKE5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
TNIKQ9UKE5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
TNIKQ9UKE5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
TNIKQ9UKE5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
TNIKQ9UKE5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
TNIKQ9UKE5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
TNIKQ9UKE5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
TNIKQ9UKE5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
TNIKQ9UKE5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
TNIKQ9UKE5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
TNIKQ9UKE5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
TNIKQ9UKE5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
TNIKQ9UKE5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
TNIKQ9UKE5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
TNIKQ9UKE5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
TNIKQ9UKE5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
TNIKQ9UKE5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms