Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SMC4Q9NTJ3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMC4Q9NTJ3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SMC4Q9NTJ3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SMC4Q9NTJ3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SMC4Q9NTJ3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SMC4Q9NTJ3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMC4Q9NTJ3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMC4Q9NTJ3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.7 ms