Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPS4Q9NQG7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPS4Q9NQG7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPS4Q9NQG7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPS4Q9NQG7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPS4Q9NQG7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPS4Q9NQG7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPS4Q9NQG7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPS4Q9NQG7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPS4Q9NQG7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPS4Q9NQG7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPS4Q9NQG7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HPS4Q9NQG7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPS4Q9NQG7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPS4Q9NQG7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPS4Q9NQG7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPS4Q9NQG7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPS4Q9NQG7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPS4Q9NQG7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPS4Q9NQG7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPS4Q9NQG7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPS4Q9NQG7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPS4Q9NQG7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPS4Q9NQG7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPS4Q9NQG7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPS4Q9NQG7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HPS4Q9NQG7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPS4Q9NQG7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.8 ms