Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCG8

CWC22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC22Q9HCG8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CWC22Q9HCG8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CWC22Q9HCG8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms