Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR1EQ9GZS1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1EQ9GZS1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms