Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CELF4Q9BZC1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CELF4Q9BZC1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms