Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
STRA6Q9BX79 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRA6Q9BX79 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRA6Q9BX79 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
STRA6Q9BX79 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRA6Q9BX79 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRA6Q9BX79 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRA6Q9BX79 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRA6Q9BX79 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRA6Q9BX79 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRA6Q9BX79 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRA6Q9BX79 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRA6Q9BX79 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRA6Q9BX79 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRA6Q9BX79 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRA6Q9BX79 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRA6Q9BX79 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms