Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS2

CCDC65, Coiled-coil domain-containing protein 65, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC65Q8IXS2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC65Q8IXS2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC65Q8IXS2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC65Q8IXS2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC65Q8IXS2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC65Q8IXS2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC65Q8IXS2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC65Q8IXS2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC65Q8IXS2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC65Q8IXS2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC65Q8IXS2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC65Q8IXS2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC65Q8IXS2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC65Q8IXS2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC65Q8IXS2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC65Q8IXS2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC65Q8IXS2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC65Q8IXS2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC65Q8IXS2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC65Q8IXS2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC65Q8IXS2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC65Q8IXS2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC65Q8IXS2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC65Q8IXS2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms