Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1S2

C3orf33, Protein C3orf33, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf33Q6P1S2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C3orf33Q6P1S2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C3orf33Q6P1S2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.33■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms