Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPP4R4Q6NUP7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP4R4Q6NUP7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms