Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PHYHD1Q5SRE7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PHYHD1Q5SRE7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms