Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
UBXN2AP68543 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBXN2AP68543 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBXN2AP68543 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBXN2AP68543 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBXN2AP68543 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBXN2AP68543 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBXN2AP68543 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBXN2AP68543 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBXN2AP68543 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBXN2AP68543 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBXN2AP68543 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBXN2AP68543 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBXN2AP68543 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBXN2AP68543 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBXN2AP68543 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
UBXN2AP68543 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBXN2AP68543 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBXN2AP68543 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBXN2AP68543 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBXN2AP68543 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBXN2AP68543 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
UBXN2AP68543 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBXN2AP68543 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBXN2AP68543 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBXN2AP68543 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBXN2AP68543 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBXN2AP68543 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBXN2AP68543 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
UBXN2AP68543 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBXN2AP68543 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBXN2AP68543 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBXN2AP68543 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms