Protein–RNA interactions for Protein: O14561

NDUFAB1, Acyl carrier protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAB1O14561 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NDUFAB1O14561 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NDUFAB1O14561 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NDUFAB1O14561 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NDUFAB1O14561 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDUFAB1O14561 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms