Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GOLGA6CA6NDK9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA6CA6NDK9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6CA6NDK9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms