Protein–RNA interactions for Protein: A0A5B9

TRBC2, T-cell receptor beta-2 chain C region, humanhuman

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Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC2A0A5B9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRBC2A0A5B9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBC2A0A5B9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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