Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RHBDD3Q9Y3P4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RHBDD3Q9Y3P4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RHBDD3Q9Y3P4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RHBDD3Q9Y3P4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RHBDD3Q9Y3P4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RHBDD3Q9Y3P4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RHBDD3Q9Y3P4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RHBDD3Q9Y3P4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RHBDD3Q9Y3P4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RHBDD3Q9Y3P4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RHBDD3Q9Y3P4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RHBDD3Q9Y3P4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RHBDD3Q9Y3P4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RHBDD3Q9Y3P4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RHBDD3Q9Y3P4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RHBDD3Q9Y3P4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RHBDD3Q9Y3P4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RHBDD3Q9Y3P4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RHBDD3Q9Y3P4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RHBDD3Q9Y3P4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RHBDD3Q9Y3P4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RHBDD3Q9Y3P4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RHBDD3Q9Y3P4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RHBDD3Q9Y3P4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RHBDD3Q9Y3P4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RHBDD3Q9Y3P4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHBDD3Q9Y3P4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDD3Q9Y3P4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms