Protein–RNA interactions for Protein: Q86U70

LDB1, LIM domain-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB1Q86U70 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LDB1Q86U70 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LDB1Q86U70 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms