Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DUSP6Q16828 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DUSP6Q16828 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUSP6Q16828 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUSP6Q16828 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUSP6Q16828 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUSP6Q16828 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DUSP6Q16828 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUSP6Q16828 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DUSP6Q16828 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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