Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
DUSP6Q16828 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
DUSP6Q16828 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
DUSP6Q16828 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
DUSP6Q16828 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
DUSP6Q16828 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
DUSP6Q16828 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
DUSP6Q16828 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35■■■■□ 3.19
DUSP6Q16828 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
DUSP6Q16828 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
DUSP6Q16828 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
DUSP6Q16828 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
DUSP6Q16828 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
DUSP6Q16828 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
DUSP6Q16828 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
DUSP6Q16828 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
DUSP6Q16828 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
DUSP6Q16828 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
DUSP6Q16828 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
DUSP6Q16828 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
DUSP6Q16828 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
DUSP6Q16828 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
DUSP6Q16828 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
DUSP6Q16828 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
DUSP6Q16828 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
DUSP6Q16828 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
DUSP6Q16828 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
DUSP6Q16828 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
DUSP6Q16828 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
DUSP6Q16828 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
DUSP6Q16828 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
DUSP6Q16828 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
DUSP6Q16828 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
DUSP6Q16828 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
DUSP6Q16828 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
DUSP6Q16828 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
DUSP6Q16828 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
DUSP6Q16828 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
DUSP6Q16828 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
DUSP6Q16828 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
DUSP6Q16828 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
DUSP6Q16828 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
DUSP6Q16828 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
DUSP6Q16828 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
DUSP6Q16828 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
DUSP6Q16828 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
DUSP6Q16828 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
DUSP6Q16828 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
DUSP6Q16828 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
DUSP6Q16828 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
DUSP6Q16828 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
DUSP6Q16828 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
DUSP6Q16828 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
DUSP6Q16828 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
DUSP6Q16828 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
DUSP6Q16828 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
DUSP6Q16828 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
DUSP6Q16828 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
DUSP6Q16828 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
DUSP6Q16828 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
DUSP6Q16828 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
DUSP6Q16828 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
DUSP6Q16828 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
DUSP6Q16828 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
DUSP6Q16828 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
DUSP6Q16828 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
DUSP6Q16828 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
DUSP6Q16828 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
DUSP6Q16828 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
DUSP6Q16828 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
DUSP6Q16828 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
DUSP6Q16828 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
DUSP6Q16828 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
DUSP6Q16828 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
DUSP6Q16828 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
DUSP6Q16828 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
DUSP6Q16828 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
DUSP6Q16828 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
DUSP6Q16828 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
DUSP6Q16828 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
DUSP6Q16828 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
DUSP6Q16828 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
DUSP6Q16828 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
DUSP6Q16828 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
DUSP6Q16828 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
DUSP6Q16828 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
DUSP6Q16828 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
DUSP6Q16828 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
DUSP6Q16828 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
DUSP6Q16828 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
DUSP6Q16828 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
DUSP6Q16828 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
DUSP6Q16828 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
DUSP6Q16828 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
DUSP6Q16828 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
DUSP6Q16828 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
DUSP6Q16828 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
DUSP6Q16828 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
DUSP6Q16828 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
DUSP6Q16828 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
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