Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN5AQ14524 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN5AQ14524 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN5AQ14524 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN5AQ14524 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN5AQ14524 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN5AQ14524 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN5AQ14524 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN5AQ14524 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN5AQ14524 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCN5AQ14524 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCN5AQ14524 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCN5AQ14524 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SCN5AQ14524 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN5AQ14524 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN5AQ14524 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN5AQ14524 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN5AQ14524 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN5AQ14524 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN5AQ14524 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN5AQ14524 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN5AQ14524 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN5AQ14524 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN5AQ14524 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN5AQ14524 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN5AQ14524 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN5AQ14524 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN5AQ14524 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN5AQ14524 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN5AQ14524 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN5AQ14524 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN5AQ14524 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN5AQ14524 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN5AQ14524 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN5AQ14524 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN5AQ14524 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN5AQ14524 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN5AQ14524 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN5AQ14524 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN5AQ14524 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN5AQ14524 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN5AQ14524 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN5AQ14524 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN5AQ14524 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN5AQ14524 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN5AQ14524 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
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