Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL1Q13616 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL1Q13616 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
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