Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIGQ13278 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIGQ13278 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIGQ13278 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIGQ13278 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIGQ13278 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIGQ13278 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIGQ13278 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIGQ13278 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIGQ13278 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIGQ13278 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIGQ13278 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIGQ13278 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIGQ13278 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIGQ13278 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIGQ13278 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIGQ13278 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIGQ13278 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RIGQ13278 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIGQ13278 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIGQ13278 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIGQ13278 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIGQ13278 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIGQ13278 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIGQ13278 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIGQ13278 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIGQ13278 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIGQ13278 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIGQ13278 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIGQ13278 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIGQ13278 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIGQ13278 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIGQ13278 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIGQ13278 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIGQ13278 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIGQ13278 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIGQ13278 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIGQ13278 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIGQ13278 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIGQ13278 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIGQ13278 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIGQ13278 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIGQ13278 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIGQ13278 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIGQ13278 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIGQ13278 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIGQ13278 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIGQ13278 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIGQ13278 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIGQ13278 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIGQ13278 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIGQ13278 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIGQ13278 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIGQ13278 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RIGQ13278 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIGQ13278 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RIGQ13278 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RIGQ13278 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RIGQ13278 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RIGQ13278 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RIGQ13278 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIGQ13278 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIGQ13278 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIGQ13278 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIGQ13278 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIGQ13278 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIGQ13278 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIGQ13278 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RIGQ13278 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIGQ13278 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIGQ13278 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIGQ13278 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIGQ13278 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIGQ13278 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIGQ13278 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIGQ13278 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIGQ13278 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIGQ13278 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIGQ13278 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIGQ13278 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIGQ13278 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIGQ13278 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIGQ13278 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIGQ13278 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIGQ13278 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIGQ13278 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIGQ13278 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIGQ13278 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIGQ13278 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIGQ13278 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIGQ13278 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIGQ13278 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIGQ13278 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIGQ13278 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIGQ13278 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIGQ13278 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIGQ13278 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIGQ13278 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIGQ13278 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIGQ13278 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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