Protein–RNA interactions for Protein: P55285

CDH6, Cadherin-6, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH6P55285 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH6P55285 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH6P55285 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH6P55285 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH6P55285 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH6P55285 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH6P55285 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH6P55285 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH6P55285 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH6P55285 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH6P55285 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH6P55285 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH6P55285 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH6P55285 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH6P55285 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH6P55285 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH6P55285 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH6P55285 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH6P55285 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH6P55285 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH6P55285 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH6P55285 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH6P55285 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH6P55285 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH6P55285 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH6P55285 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH6P55285 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH6P55285 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH6P55285 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH6P55285 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH6P55285 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH6P55285 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH6P55285 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH6P55285 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH6P55285 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH6P55285 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH6P55285 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH6P55285 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH6P55285 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH6P55285 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH6P55285 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH6P55285 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH6P55285 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH6P55285 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH6P55285 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH6P55285 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH6P55285 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH6P55285 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH6P55285 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH6P55285 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH6P55285 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH6P55285 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH6P55285 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH6P55285 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH6P55285 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH6P55285 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH6P55285 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH6P55285 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH6P55285 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH6P55285 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH6P55285 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH6P55285 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH6P55285 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH6P55285 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH6P55285 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH6P55285 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH6P55285 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH6P55285 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH6P55285 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH6P55285 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH6P55285 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH6P55285 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH6P55285 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH6P55285 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH6P55285 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH6P55285 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH6P55285 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH6P55285 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH6P55285 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH6P55285 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH6P55285 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH6P55285 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH6P55285 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH6P55285 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH6P55285 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH6P55285 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH6P55285 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH6P55285 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH6P55285 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH6P55285 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH6P55285 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH6P55285 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH6P55285 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH6P55285 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH6P55285 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH6P55285 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH6P55285 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH6P55285 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH6P55285 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH6P55285 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms