Protein–RNA interactions for Protein: P39023

RPL3, 60S ribosomal protein L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3P39023 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL3P39023 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL3P39023 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL3P39023 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL3P39023 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL3P39023 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL3P39023 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL3P39023 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL3P39023 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL3P39023 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL3P39023 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL3P39023 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL3P39023 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL3P39023 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL3P39023 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL3P39023 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL3P39023 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL3P39023 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL3P39023 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL3P39023 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL3P39023 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL3P39023 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL3P39023 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL3P39023 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL3P39023 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL3P39023 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL3P39023 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL3P39023 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL3P39023 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL3P39023 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL3P39023 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL3P39023 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL3P39023 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL3P39023 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL3P39023 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL3P39023 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL3P39023 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL3P39023 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPL3P39023 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPL3P39023 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL3P39023 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL3P39023 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL3P39023 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL3P39023 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL3P39023 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL3P39023 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL3P39023 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL3P39023 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL3P39023 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL3P39023 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL3P39023 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL3P39023 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL3P39023 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL3P39023 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL3P39023 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL3P39023 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL3P39023 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL3P39023 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL3P39023 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL3P39023 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL3P39023 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL3P39023 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL3P39023 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL3P39023 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL3P39023 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL3P39023 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL3P39023 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL3P39023 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL3P39023 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL3P39023 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL3P39023 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL3P39023 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL3P39023 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL3P39023 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL3P39023 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL3P39023 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL3P39023 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL3P39023 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL3P39023 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL3P39023 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL3P39023 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL3P39023 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL3P39023 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL3P39023 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL3P39023 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL3P39023 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL3P39023 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL3P39023 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL3P39023 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL3P39023 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL3P39023 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL3P39023 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL3P39023 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL3P39023 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPL3P39023 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPL3P39023 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL3P39023 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL3P39023 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL3P39023 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL3P39023 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150 ms