Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
ITGB4P16144 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
ITGB4P16144 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
ITGB4P16144 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ITGB4P16144 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ITGB4P16144 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
ITGB4P16144 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
ITGB4P16144 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ITGB4P16144 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ITGB4P16144 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ITGB4P16144 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ITGB4P16144 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ITGB4P16144 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ITGB4P16144 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ITGB4P16144 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
ITGB4P16144 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
ITGB4P16144 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ITGB4P16144 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ITGB4P16144 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ITGB4P16144 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
ITGB4P16144 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ITGB4P16144 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ITGB4P16144 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ITGB4P16144 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ITGB4P16144 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ITGB4P16144 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ITGB4P16144 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ITGB4P16144 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ITGB4P16144 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
ITGB4P16144 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ITGB4P16144 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITGB4P16144 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITGB4P16144 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITGB4P16144 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITGB4P16144 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ITGB4P16144 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ITGB4P16144 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ITGB4P16144 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITGB4P16144 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITGB4P16144 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITGB4P16144 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITGB4P16144 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ITGB4P16144 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ITGB4P16144 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ITGB4P16144 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ITGB4P16144 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ITGB4P16144 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
ITGB4P16144 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
ITGB4P16144 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ITGB4P16144 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms