Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKHD1P08F94 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms