Protein–RNA interactions for Protein: O75783

RHBDL1, Rhomboid-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL1O75783 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDL1O75783 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL1O75783 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDL1O75783 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms