Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS11DO60235 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS11DO60235 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS11DO60235 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS11DO60235 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS11DO60235 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS11DO60235 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS11DO60235 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS11DO60235 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS11DO60235 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS11DO60235 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS11DO60235 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS11DO60235 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS11DO60235 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPRSS11DO60235 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS11DO60235 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms