Protein–RNA interactions for Protein: A6NLF2

ELOA3D, Elongin-A3 member D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOA3DA6NLF2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ELOA3DA6NLF2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ELOA3DA6NLF2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ELOA3DA6NLF2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELOA3DA6NLF2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELOA3DA6NLF2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELOA3DA6NLF2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELOA3DA6NLF2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELOA3DA6NLF2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELOA3DA6NLF2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELOA3DA6NLF2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ELOA3DA6NLF2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ELOA3DA6NLF2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ELOA3DA6NLF2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms