Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ARID3CA6NKF2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ARID3CA6NKF2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ARID3CA6NKF2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ARID3CA6NKF2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
ARID3CA6NKF2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
ARID3CA6NKF2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ARID3CA6NKF2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
ARID3CA6NKF2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ARID3CA6NKF2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ARID3CA6NKF2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
ARID3CA6NKF2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
ARID3CA6NKF2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
ARID3CA6NKF2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
ARID3CA6NKF2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
ARID3CA6NKF2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
ARID3CA6NKF2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
ARID3CA6NKF2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
ARID3CA6NKF2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
ARID3CA6NKF2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
ARID3CA6NKF2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
ARID3CA6NKF2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
ARID3CA6NKF2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
ARID3CA6NKF2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC37.62■■■■□ 3.61
ARID3CA6NKF2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
ARID3CA6NKF2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ARID3CA6NKF2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ARID3CA6NKF2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
ARID3CA6NKF2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ARID3CA6NKF2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
ARID3CA6NKF2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
ARID3CA6NKF2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
ARID3CA6NKF2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
ARID3CA6NKF2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
ARID3CA6NKF2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
ARID3CA6NKF2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
ARID3CA6NKF2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
ARID3CA6NKF2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
ARID3CA6NKF2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
ARID3CA6NKF2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
ARID3CA6NKF2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
ARID3CA6NKF2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
ARID3CA6NKF2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
ARID3CA6NKF2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
ARID3CA6NKF2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
ARID3CA6NKF2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
ARID3CA6NKF2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
ARID3CA6NKF2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
ARID3CA6NKF2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ARID3CA6NKF2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ARID3CA6NKF2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
ARID3CA6NKF2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
ARID3CA6NKF2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
ARID3CA6NKF2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
ARID3CA6NKF2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
ARID3CA6NKF2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
ARID3CA6NKF2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
ARID3CA6NKF2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
ARID3CA6NKF2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
ARID3CA6NKF2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
ARID3CA6NKF2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
ARID3CA6NKF2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ARID3CA6NKF2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC37.52■■■■□ 3.6
ARID3CA6NKF2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
ARID3CA6NKF2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
ARID3CA6NKF2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
ARID3CA6NKF2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
ARID3CA6NKF2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
ARID3CA6NKF2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
ARID3CA6NKF2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ARID3CA6NKF2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ARID3CA6NKF2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ARID3CA6NKF2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ARID3CA6NKF2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
ARID3CA6NKF2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
ARID3CA6NKF2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
ARID3CA6NKF2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ARID3CA6NKF2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ARID3CA6NKF2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ARID3CA6NKF2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
ARID3CA6NKF2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ARID3CA6NKF2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ARID3CA6NKF2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ARID3CA6NKF2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
ARID3CA6NKF2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
ARID3CA6NKF2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
ARID3CA6NKF2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
ARID3CA6NKF2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
ARID3CA6NKF2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
ARID3CA6NKF2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
ARID3CA6NKF2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
ARID3CA6NKF2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
ARID3CA6NKF2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ARID3CA6NKF2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ARID3CA6NKF2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ARID3CA6NKF2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ARID3CA6NKF2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ARID3CA6NKF2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ARID3CA6NKF2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ARID3CA6NKF2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms