Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
STRCP1A6NGW2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
STRCP1A6NGW2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
STRCP1A6NGW2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
STRCP1A6NGW2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
STRCP1A6NGW2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
STRCP1A6NGW2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
STRCP1A6NGW2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
STRCP1A6NGW2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
STRCP1A6NGW2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
STRCP1A6NGW2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
STRCP1A6NGW2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
STRCP1A6NGW2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
STRCP1A6NGW2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
STRCP1A6NGW2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
STRCP1A6NGW2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
STRCP1A6NGW2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
STRCP1A6NGW2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
STRCP1A6NGW2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
STRCP1A6NGW2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
STRCP1A6NGW2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
STRCP1A6NGW2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
STRCP1A6NGW2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
STRCP1A6NGW2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
STRCP1A6NGW2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
STRCP1A6NGW2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
STRCP1A6NGW2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
STRCP1A6NGW2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
STRCP1A6NGW2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
STRCP1A6NGW2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
STRCP1A6NGW2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
STRCP1A6NGW2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
STRCP1A6NGW2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
STRCP1A6NGW2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
STRCP1A6NGW2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
STRCP1A6NGW2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
STRCP1A6NGW2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
STRCP1A6NGW2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
STRCP1A6NGW2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
STRCP1A6NGW2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
STRCP1A6NGW2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
STRCP1A6NGW2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
STRCP1A6NGW2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
STRCP1A6NGW2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
STRCP1A6NGW2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC33.82■■■■□ 3
STRCP1A6NGW2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
STRCP1A6NGW2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
STRCP1A6NGW2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
STRCP1A6NGW2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
STRCP1A6NGW2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
STRCP1A6NGW2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
STRCP1A6NGW2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
STRCP1A6NGW2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
STRCP1A6NGW2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
STRCP1A6NGW2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
STRCP1A6NGW2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
STRCP1A6NGW2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
STRCP1A6NGW2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC33.78■■■■□ 3
STRCP1A6NGW2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
STRCP1A6NGW2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
STRCP1A6NGW2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
STRCP1A6NGW2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
STRCP1A6NGW2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC33.77■■■■□ 3
STRCP1A6NGW2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
STRCP1A6NGW2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
STRCP1A6NGW2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
STRCP1A6NGW2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
STRCP1A6NGW2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
STRCP1A6NGW2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
STRCP1A6NGW2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
STRCP1A6NGW2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
STRCP1A6NGW2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
STRCP1A6NGW2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
STRCP1A6NGW2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
STRCP1A6NGW2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
STRCP1A6NGW2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
STRCP1A6NGW2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
STRCP1A6NGW2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
STRCP1A6NGW2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
STRCP1A6NGW2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
STRCP1A6NGW2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
STRCP1A6NGW2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
STRCP1A6NGW2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
STRCP1A6NGW2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
STRCP1A6NGW2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
STRCP1A6NGW2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
STRCP1A6NGW2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms