Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRD1A4D1F6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRD1A4D1F6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms