Protein–RNA interactions for Protein: A1L4H1

SSC5D, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC5DA1L4H1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SSC5DA1L4H1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SSC5DA1L4H1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SSC5DA1L4H1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SSC5DA1L4H1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SSC5DA1L4H1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SSC5DA1L4H1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SSC5DA1L4H1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SSC5DA1L4H1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSC5DA1L4H1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSC5DA1L4H1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSC5DA1L4H1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSC5DA1L4H1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SSC5DA1L4H1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SSC5DA1L4H1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SSC5DA1L4H1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SSC5DA1L4H1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SSC5DA1L4H1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SSC5DA1L4H1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SSC5DA1L4H1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SSC5DA1L4H1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SSC5DA1L4H1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSC5DA1L4H1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSC5DA1L4H1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSC5DA1L4H1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSC5DA1L4H1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSC5DA1L4H1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSC5DA1L4H1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSC5DA1L4H1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SSC5DA1L4H1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SSC5DA1L4H1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SSC5DA1L4H1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SSC5DA1L4H1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SSC5DA1L4H1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SSC5DA1L4H1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SSC5DA1L4H1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SSC5DA1L4H1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SSC5DA1L4H1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SSC5DA1L4H1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SSC5DA1L4H1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SSC5DA1L4H1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SSC5DA1L4H1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SSC5DA1L4H1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SSC5DA1L4H1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SSC5DA1L4H1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SSC5DA1L4H1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SSC5DA1L4H1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SSC5DA1L4H1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SSC5DA1L4H1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SSC5DA1L4H1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SSC5DA1L4H1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SSC5DA1L4H1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SSC5DA1L4H1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SSC5DA1L4H1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SSC5DA1L4H1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SSC5DA1L4H1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SSC5DA1L4H1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SSC5DA1L4H1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSC5DA1L4H1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSC5DA1L4H1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSC5DA1L4H1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSC5DA1L4H1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSC5DA1L4H1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSC5DA1L4H1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms