Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRPRBQ9Y5M8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRPRBQ9Y5M8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRPRBQ9Y5M8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRPRBQ9Y5M8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SRPRBQ9Y5M8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRPRBQ9Y5M8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SRPRBQ9Y5M8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms