Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASS4Q9NQ75 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASS4Q9NQ75 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASS4Q9NQ75 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms