Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
ALS2Q96Q42 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ALS2Q96Q42 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ALS2Q96Q42 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ALS2Q96Q42 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ALS2Q96Q42 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ALS2Q96Q42 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ALS2Q96Q42 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
ALS2Q96Q42 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ALS2Q96Q42 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ALS2Q96Q42 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ALS2Q96Q42 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ALS2Q96Q42 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
ALS2Q96Q42 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ALS2Q96Q42 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
ALS2Q96Q42 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ALS2Q96Q42 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ALS2Q96Q42 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ALS2Q96Q42 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ALS2Q96Q42 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ALS2Q96Q42 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ALS2Q96Q42 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
ALS2Q96Q42 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
ALS2Q96Q42 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ALS2Q96Q42 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ALS2Q96Q42 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
ALS2Q96Q42 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ALS2Q96Q42 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ALS2Q96Q42 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ALS2Q96Q42 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ALS2Q96Q42 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ALS2Q96Q42 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ALS2Q96Q42 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ALS2Q96Q42 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
ALS2Q96Q42 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ALS2Q96Q42 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ALS2Q96Q42 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ALS2Q96Q42 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ALS2Q96Q42 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ALS2Q96Q42 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ALS2Q96Q42 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ALS2Q96Q42 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ALS2Q96Q42 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
ALS2Q96Q42 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
ALS2Q96Q42 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ALS2Q96Q42 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ALS2Q96Q42 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ALS2Q96Q42 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ALS2Q96Q42 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ALS2Q96Q42 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ALS2Q96Q42 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ALS2Q96Q42 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ALS2Q96Q42 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ALS2Q96Q42 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ALS2Q96Q42 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ALS2Q96Q42 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ALS2Q96Q42 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ALS2Q96Q42 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ALS2Q96Q42 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms