Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGD4Q96M96 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGD4Q96M96 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD4Q96M96 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms